18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1067 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1067  patatin  100 
 
 		 468 aa  960    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  39.29 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  37.29 
 
 		 467 aa  289  8e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 497 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  35.69 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  29.7 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  30.3 
 
 		 516 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  31.05 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  30.07 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  29.38 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  30.56 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  29.64 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  28.66 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  27.47 
 
 		 590 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  27.47 
 
 		 590 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  29.34 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  27.49 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0946  patatin  26.88 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>