17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0946 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0946  patatin  100 
 
 		 364 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  36.34 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  31.49 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  32.31 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  30.6 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  29.69 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  26.55 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  43.06 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  27.1 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  29.44 
 
 		 590 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  29.44 
 
 		 590 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  32.4 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  27.44 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  58.54 
 
 		 77 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  50 
 
 		 1120 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  45.24 
 
 		 680 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  25.67 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>