25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1775 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  100 
 
 		 361 aa  749    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0946  patatin  36.54 
 
 		 364 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  26.73 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  30.53 
 
 		 422 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  25.71 
 
 		 466 aa  87  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  26.79 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  24.75 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  26.2 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  26.02 
 
 		 498 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  56.82 
 
 		 77 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  28.23 
 
 		 740 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  51.06 
 
 		 869 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  48.98 
 
 		 1120 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  51.11 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  25.38 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  57.5 
 
 		 1241 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  25.45 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  36.62 
 
 		 892 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  60.53 
 
 		 913 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  50 
 
 		 887 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  46.34 
 
 		 680 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  32.35 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  52.5 
 
 		 877 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  46.51 
 
 		 550 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  34.21 
 
 		 809 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>