19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3973 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1773    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  40.5 
 
 		 809 aa  229  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  39.73 
 
 		 913 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  33.69 
 
 		 680 aa  193  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  33.25 
 
 		 935 aa  159  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  31.26 
 
 		 1120 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  32.51 
 
 		 828 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  29.4 
 
 		 869 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  30.05 
 
 		 945 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  30.86 
 
 		 935 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  29.22 
 
 		 713 aa  114  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1241 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  28.88 
 
 		 960 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  28.1 
 
 		 916 aa  99  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  31.21 
 
 		 887 aa  98.6  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  53.33 
 
 		 392 aa  51.6  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  36 
 
 		 550 aa  51.2  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  44.26 
 
 		 77 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  54.35 
 
 		 336 aa  48.5  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>