26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0545 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  55.56 
 
 		 336 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  53.23 
 
 		 392 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  41.98 
 
 		 459 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  56.82 
 
 		 361 aa  52  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  49.06 
 
 		 386 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  40 
 
 		 471 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  52.08 
 
 		 466 aa  51.2  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  44.26 
 
 		 877 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  40.98 
 
 		 422 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  45 
 
 		 497 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  50 
 
 		 809 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  42.25 
 
 		 461 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  39.73 
 
 		 516 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  46 
 
 		 498 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  39.73 
 
 		 527 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  42 
 
 		 680 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  40.3 
 
 		 460 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  46.67 
 
 		 713 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  44.07 
 
 		 887 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  55.56 
 
 		 913 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  42.62 
 
 		 828 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  38.98 
 
 		 467 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  38.57 
 
 		 480 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  42.11 
 
 		 869 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  40.91 
 
 		 550 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>