24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1795 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 680 aa  1394    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  31.38 
 
 		 913 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  36.68 
 
 		 809 aa  205  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  35.95 
 
 		 828 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  33.49 
 
 		 869 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  32.97 
 
 		 935 aa  187  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1120 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  33.42 
 
 		 877 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  29.46 
 
 		 713 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  33.21 
 
 		 1241 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  25.39 
 
 		 945 aa  111  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  30.04 
 
 		 916 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  30.66 
 
 		 887 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  34.44 
 
 		 935 aa  100  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  27.5 
 
 		 960 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  51.92 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  50 
 
 		 460 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  42 
 
 		 77 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  35.14 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  48.84 
 
 		 550 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  42.31 
 
 		 336 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  44.23 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  31.76 
 
 		 498 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  46.34 
 
 		 361 aa  44.3  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>