20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4031 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  100 
 
 		 1120 aa  2295    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  33.01 
 
 		 935 aa  356  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  32.22 
 
 		 680 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  34.09 
 
 		 809 aa  163  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  31.4 
 
 		 913 aa  155  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  30.34 
 
 		 877 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1241 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  31.06 
 
 		 916 aa  138  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  27.61 
 
 		 887 aa  126  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  25.45 
 
 		 713 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  28.1 
 
 		 828 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  28.9 
 
 		 935 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  25.42 
 
 		 869 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  25.5 
 
 		 945 aa  90.9  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  24.54 
 
 		 960 aa  68.6  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  48.98 
 
 		 361 aa  49.3  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  43.75 
 
 		 392 aa  48.1  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  35.8 
 
 		 386 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  33.04 
 
 		 336 aa  45.8  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  51.22 
 
 		 466 aa  45.1  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>