23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2907 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  41.65 
 
 		 913 aa  277  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  40.21 
 
 		 877 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  36.68 
 
 		 680 aa  219  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  35.79 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1120 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  29.3 
 
 		 713 aa  144  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  30.27 
 
 		 828 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  29.47 
 
 		 869 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  30.41 
 
 		 945 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1241 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  27.36 
 
 		 916 aa  110  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  28.85 
 
 		 960 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  25.97 
 
 		 887 aa  98.6  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  27.29 
 
 		 935 aa  91.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  53.06 
 
 		 336 aa  54.7  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  48.94 
 
 		 550 aa  48.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  39.34 
 
 		 471 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  48.89 
 
 		 392 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  37.5 
 
 		 459 aa  45.1  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  39.66 
 
 		 460 aa  44.3  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  36.49 
 
 		 497 aa  44.3  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>