11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2371 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1142    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0481  hypothetical protein  24.92 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  48.84 
 
 		 877 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  51.11 
 
 		 713 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  48.94 
 
 		 809 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  41.51 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  32.5 
 
 		 828 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  48.84 
 
 		 680 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  32.93 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  32.88 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48846  Lysophospholipase  39.68 
 
 		 631 aa  43.9  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>