63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0658 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  100 
 
 		 392 aa  801    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  25.68 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  30.08 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  24.75 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  30.15 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  26.6 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  26.5 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  53.23 
 
 		 77 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  51.92 
 
 		 680 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  25.86 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  53.33 
 
 		 877 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0946  patatin  26.47 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  43.08 
 
 		 733 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  42.62 
 
 		 727 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  25.45 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  40.98 
 
 		 728 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  40.98 
 
 		 751 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  49.09 
 
 		 728 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  43.48 
 
 		 550 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  40.98 
 
 		 728 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  44.44 
 
 		 746 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  24.78 
 
 		 480 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  52.17 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  45.45 
 
 		 728 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1120 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  24.1 
 
 		 516 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  24.23 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  49.06 
 
 		 760 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  40 
 
 		 305 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  47.06 
 
 		 913 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  40 
 
 		 306 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  43.48 
 
 		 256 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  40 
 
 		 305 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  47.17 
 
 		 302 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  47.17 
 
 		 308 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  48 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  40 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  40 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  48.89 
 
 		 809 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  50 
 
 		 869 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  40 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  40 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  40 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  45.28 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  45.28 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  23.16 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  47.83 
 
 		 713 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  39.39 
 
 		 923 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  34.29 
 
 		 720 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  38.71 
 
 		 330 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  33.85 
 
 		 728 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  48 
 
 		 935 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  45.28 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  40.68 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  40.62 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  48.15 
 
 		 813 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  37.18 
 
 		 740 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  36.36 
 
 		 909 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  47.06 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  34.95 
 
 		 461 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  24.56 
 
 		 740 aa  43.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  43.33 
 
 		 311 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  42.37 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>