20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1455 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1455  patatin  100 
 
 		 480 aa  988    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  39.69 
 
 		 467 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  37.92 
 
 		 468 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  38.66 
 
 		 497 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  38.11 
 
 		 467 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  33.76 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  32.63 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  33.19 
 
 		 471 aa  193  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  31.75 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  28.44 
 
 		 516 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  28.2 
 
 		 527 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  26 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  31.75 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  28.8 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  28.8 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  29.66 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  25.19 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  26.2 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  34.48 
 
 		 392 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  22.52 
 
 		 466 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>