24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6768 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6768  patatin  100 
 
 		 498 aa  1020    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 497 aa  104  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  31.75 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  28.13 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  26.54 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  29.64 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  28.28 
 
 		 590 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  28.28 
 
 		 590 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  28.06 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  31.93 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  28.62 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  28.25 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  27.74 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  27.74 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  28.42 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  29.17 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  25.41 
 
 		 527 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  25.48 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  25.44 
 
 		 392 aa  52  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0946  patatin  26.55 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  40.74 
 
 		 887 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  46 
 
 		 77 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  31.76 
 
 		 680 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  53.49 
 
 		 466 aa  44.3  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>