22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2584 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  100 
 
 		 497 aa  1008    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  41.52 
 
 		 467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  38.46 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  34.81 
 
 		 468 aa  246  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  32.57 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  32.15 
 
 		 459 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  33.04 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  32.61 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  29.41 
 
 		 516 aa  127  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  29.41 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  31.98 
 
 		 460 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  30.6 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  26.07 
 
 		 453 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  27.76 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  25.08 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  25.08 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  26.14 
 
 		 386 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  45 
 
 		 77 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  35.14 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  36.9 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  31.87 
 
 		 887 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  36.49 
 
 		 809 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>