22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2273 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1998  patatin  90.17 
 
 		 459 aa  817    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  100 
 
 		 471 aa  949    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  68.78 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  65.71 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  38.58 
 
 		 516 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  38.36 
 
 		 527 aa  296  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  32.67 
 
 		 480 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  29.58 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 497 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  29.61 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  29.78 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  28.62 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  26.91 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  26.62 
 
 		 453 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  27.01 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  27.01 
 
 		 590 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  29.08 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  38.1 
 
 		 77 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  27.12 
 
 		 296 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  39.34 
 
 		 809 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 887 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  44.23 
 
 		 680 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>