22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2266 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  73.23 
 
 		 461 aa  654    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  100 
 
 		 460 aa  923    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  67.82 
 
 		 459 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  68.78 
 
 		 471 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1623  hypothetical protein  42.26 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1566  hypothetical protein  41.77 
 
 		 527 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  31.65 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  30.56 
 
 		 468 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  31.98 
 
 		 497 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  27.29 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  28.54 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  27.74 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  27.48 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  27.48 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  23.13 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  26.42 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  28.8 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  50 
 
 		 680 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  32.71 
 
 		 887 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  40.3 
 
 		 77 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  23.16 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  39.66 
 
 		 809 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>