15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1025 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1025  patatin  100 
 
 		 453 aa  939    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  34.39 
 
 		 590 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  34.39 
 
 		 590 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  26.17 
 
 		 480 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  28.99 
 
 		 467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  28.13 
 
 		 498 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  26.07 
 
 		 497 aa  95.9  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1067  patatin  28.66 
 
 		 468 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2062  patatin  25.82 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  29 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1998  patatin  28.19 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2273  patatin  34.95 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0626503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2266  patatin  22.42 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.745618  normal  0.307315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3515  Patatin  22.99 
 
 		 461 aa  46.6  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  24.1 
 
 		 386 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>