17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17250 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  100 
 
 		 466 aa  919    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  29.34 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  29.85 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  28.26 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  25.71 
 
 		 361 aa  72  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0946  patatin  29.69 
 
 		 364 aa  67  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  51.85 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  52.08 
 
 		 77 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0076  patatin family protein  27.24 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.869707  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  56.52 
 
 		 935 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  32.93 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0547  hypothetical protein  28.83 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41292  predicted protein  42.47 
 
 		 566 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.278724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  51.22 
 
 		 1120 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  22.52 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  53.49 
 
 		 498 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48799  predicted protein  46.94 
 
 		 892 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>