16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5962 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  100 
 
 
935 aa  1881    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  34.08 
 
 
1120 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  32.97 
 
 
680 aa  189  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  35.25 
 
 
809 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  33.25 
 
 
877 aa  155  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  31.46 
 
 
913 aa  140  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  31.07 
 
 
1241 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  29.02 
 
 
713 aa  131  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  31.64 
 
 
916 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  30.68 
 
 
935 aa  128  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  28.36 
 
 
887 aa  119  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  28.5 
 
 
945 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  26.73 
 
 
869 aa  98.6  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  27.99 
 
 
828 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  26.46 
 
 
960 aa  94.7  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  56.52 
 
 
466 aa  48.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0268924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>