19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4343 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  100 
 
 		 913 aa  1850    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  41.65 
 
 		 809 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  39.46 
 
 		 877 aa  221  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  33.5 
 
 		 680 aa  194  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1120 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  39.22 
 
 		 935 aa  149  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  34.26 
 
 		 828 aa  145  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  31.54 
 
 		 869 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  31.07 
 
 		 713 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1241 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  31.08 
 
 		 945 aa  118  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  29.97 
 
 		 960 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  28.61 
 
 		 916 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  25.54 
 
 		 887 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  33.9 
 
 		 935 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2518  hypothetical protein  37.61 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5110  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  47.06 
 
 		 392 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  58.97 
 
 		 361 aa  45.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>