18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1652 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  66.15 
 
 		 828 aa  1037    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1754    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  33.97 
 
 		 680 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  32.05 
 
 		 913 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  32.73 
 
 		 877 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  29.47 
 
 		 809 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1120 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  28.8 
 
 		 945 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  27.8 
 
 		 713 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  27.61 
 
 		 935 aa  106  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1241 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  25.6 
 
 		 960 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  25.4 
 
 		 935 aa  78.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  24.45 
 
 		 887 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  24.58 
 
 		 916 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  52.17 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  50 
 
 		 392 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  44.78 
 
 		 336 aa  45.8  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>