18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3029 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1402    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  33.75 
 
 		 945 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  30.03 
 
 		 680 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  32.16 
 
 		 960 aa  135  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  29.57 
 
 		 809 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  28.57 
 
 		 935 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  31.93 
 
 		 913 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1120 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  29.37 
 
 		 877 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  28.03 
 
 		 869 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  28.64 
 
 		 828 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1241 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  31.94 
 
 		 916 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  33.98 
 
 		 935 aa  80.5  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  27.14 
 
 		 887 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  51.11 
 
 		 550 aa  49.7  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  47.83 
 
 		 392 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  46.67 
 
 		 77 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>