19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3836 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3836  hypothetical protein  100 
 
 		 828 aa  1662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1652  hypothetical protein  66.11 
 
 		 869 aa  1060    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.296706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1795  hypothetical protein  35.95 
 
 		 680 aa  210  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0505644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4343  hypothetical protein  33.98 
 
 		 913 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316221  normal  0.363569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2907  hypothetical protein  30.14 
 
 		 809 aa  144  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.415179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3973  hypothetical protein  30.71 
 
 		 877 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0974285  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1120 aa  124  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22950  hypothetical protein  28.76 
 
 		 945 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.544258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3029  hypothetical protein  27.45 
 
 		 713 aa  114  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0560209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2824  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1241 aa  106  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0780717  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5962  hypothetical protein  27.55 
 
 		 935 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1788  hypothetical protein  27.32 
 
 		 960 aa  92.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0736583  normal  0.105048 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5937  hypothetical protein  31.21 
 
 		 935 aa  85.9  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2474  hypothetical protein  23.91 
 
 		 887 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5544  hypothetical protein  24.63 
 
 		 916 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.936805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  47.54 
 
 		 336 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  51.11 
 
 		 361 aa  48.5  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  52.17 
 
 		 392 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2371  hypothetical protein  40 
 
 		 550 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>