23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1412 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1412  Patatin  100 
 
 		 422 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1791  patatin  39.85 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0415582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1852  patatin  34.66 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17250  Patatin-like phospholipase  28.26 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0268924 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1775  patatin  30.53 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0946  patatin  32.31 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.239636  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6768  patatin  29.06 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.0432181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0658  patatin  30.15 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4248  patatin  30.2 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4118  patatin  30.2 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  25.27 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1455  patatin  27.57 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000881553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1399  patatin  25 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0398519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0547  hypothetical protein  31.11 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2584  putative lipoprotein  27.47 
 
 		 497 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0545  hypothetical protein  40.98 
 
 		 77 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.11 
 
 		 727 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  23.72 
 
 		 740 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  26.56 
 
 		 746 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.51 
 
 		 760 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4031  hypothetical protein  43.14 
 
 		 1120 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  24.28 
 
 		 741 aa  43.1  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1025  patatin  25.19 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>