More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2164 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  100 
 
 		 398 aa  800    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  86.8 
 
 		 394 aa  684    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  52.5 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  50.14 
 
 		 411 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  47.41 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  33.75 
 
 		 420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  37.01 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  36.41 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  28.83 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  27.01 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  35.56 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.3 
 
 		 767 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  29 
 
 		 748 aa  79.7  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  30.56 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.9 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.91 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.9 
 
 		 751 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.6 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  27.13 
 
 		 920 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  27.32 
 
 		 728 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  27.32 
 
 		 933 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.41 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  30.45 
 
 		 804 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.45 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.45 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  27.13 
 
 		 930 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  27.32 
 
 		 945 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.96 
 
 		 740 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.45 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  30.29 
 
 		 322 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.16 
 
 		 798 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.16 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  29.44 
 
 		 739 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.78 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  29.03 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.68 
 
 		 852 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30.24 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  31.5 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  28.81 
 
 		 777 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  30.88 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  28.57 
 
 		 894 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  27.05 
 
 		 714 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  31.42 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  26.67 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.44 
 
 		 733 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  28.9 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  31.58 
 
 		 294 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.41 
 
 		 316 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  28.19 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  43.75 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.72 
 
 		 741 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  27.55 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.76 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  28.23 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  28.23 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  29.54 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  29.44 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  34.45 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  28.57 
 
 		 813 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  32.05 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  24.07 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  29.74 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  28.99 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.8 
 
 		 728 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  27.47 
 
 		 909 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  31.08 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  31.08 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  28.89 
 
 		 923 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  31.36 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.78 
 
 		 740 aa  63.2  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  26.64 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.46 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  27.23 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  25.54 
 
 		 256 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.64 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  31.36 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  27.23 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  26.52 
 
 		 950 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  31.36 
 
 		 301 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27.23 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  31.76 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  27.82 
 
 		 737 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  30.24 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  27.82 
 
 		 738 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  27.82 
 
 		 738 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  30.12 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.92 
 
 		 790 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  26.07 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  29.76 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  32.19 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.76 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  27.24 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  28.24 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1546  patatin-like phospholipase family protein  25.34 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0945902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.1 
 
 		 760 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  28.22 
 
 		 754 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  27.09 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  26.98 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1826  patatin family phospholipase  25.34 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>