112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5830 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5830  patatin  100 
 
 		 411 aa  787    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  69.19 
 
 		 351 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  40.66 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  29.18 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  32.08 
 
 		 309 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  28.45 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  25.21 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  32.05 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  27.69 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  35.77 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  29.61 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  37.98 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  28.06 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  30.43 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  30.29 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  30.43 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  30.43 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  30.86 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  29.91 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  27.83 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  27.57 
 
 		 276 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  31.18 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  24.84 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  25.2 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  29.01 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.65 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  30.2 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  34.67 
 
 		 314 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  45.76 
 
 		 302 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  34.81 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  29.73 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  26.07 
 
 		 923 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  31.93 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  26.67 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  32.28 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  26.11 
 
 		 293 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.13 
 
 		 798 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.13 
 
 		 796 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  25.56 
 
 		 253 aa  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  53.7 
 
 		 330 aa  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  35.37 
 
 		 318 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  35.37 
 
 		 318 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  40.3 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  29.25 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.63 
 
 		 733 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  31.25 
 
 		 308 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  46.55 
 
 		 327 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  28.23 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  30.33 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.29 
 
 		 803 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.29 
 
 		 803 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  32.14 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  33.87 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  32.14 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.29 
 
 		 803 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  35.8 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  44.83 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  38.98 
 
 		 330 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  34.15 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.06 
 
 		 767 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  51.85 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  38.71 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  44.83 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  41.38 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  41.38 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  25.78 
 
 		 728 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  25.61 
 
 		 727 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  41.38 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  27.66 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  27.66 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  27.46 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  21.28 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.69 
 
 		 741 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  41.38 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  24.73 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  41.38 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  25.44 
 
 		 728 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  28.18 
 
 		 745 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  25.98 
 
 		 520 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.56 
 
 		 751 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  39.66 
 
 		 308 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  38.1 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.67 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  39.66 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  26.84 
 
 		 930 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  26.84 
 
 		 920 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  26.84 
 
 		 852 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  49.06 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  25.42 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  40.68 
 
 		 216 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  39.66 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.42 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  26.84 
 
 		 933 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  26.84 
 
 		 945 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  26.84 
 
 		 728 aa  43.9  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  34.72 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  43.64 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  28.87 
 
 		 804 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  35.63 
 
 		 223 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  35.8 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>