232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0999 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0999  patatin  100 
 
 		 276 aa  533  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  54.3 
 
 		 283 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  42.7 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  44.68 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  42.64 
 
 		 283 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  43.16 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  43.16 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  43.16 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  42.25 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  40.75 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  45.52 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  45.61 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  39.8 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  40.97 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  38.23 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  39.11 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  41.03 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  35.83 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  29.29 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  33 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  28.66 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  29.41 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  39.8 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  29.1 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  28.96 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  29.72 
 
 		 397 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  31.12 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  32.1 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  29.41 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.22 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  31.16 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.01 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  31.66 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  27.64 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  31.16 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 624 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.67 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  31.28 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  27.27 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  32.16 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  33.65 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  32.2 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  34.2 
 
 		 583 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  26.74 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  33.82 
 
 		 581 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  30.3 
 
 		 727 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.54 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  30.15 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  29.9 
 
 		 746 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.15 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  29.87 
 
 		 728 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.87 
 
 		 728 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  26.67 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.87 
 
 		 751 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  32.82 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  30.15 
 
 		 474 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  28.95 
 
 		 405 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.3 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  28.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  28.78 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  28.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  30.15 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  30.15 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.15 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  31.43 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  29.29 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  28.96 
 
 		 405 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  28.22 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  29.76 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  28.08 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.08 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  26.98 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30.41 
 
 		 345 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  29.3 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.08 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.65 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  28.04 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  27.63 
 
 		 390 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  28.63 
 
 		 733 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.27 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  28.51 
 
 		 390 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  32.28 
 
 		 390 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  30.37 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  28.51 
 
 		 412 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.11 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  27.63 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 748 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  27.63 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  27.63 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  27.63 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  27.63 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.4 
 
 		 311 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.37 
 
 		 728 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.5 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  27.52 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  32.16 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  31.69 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  29.27 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  29.1 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>