More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1144 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1144  patatin  100 
 
 		 411 aa  833    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  51.92 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  50.14 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  50.84 
 
 		 394 aa  345  6e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  40.74 
 
 		 424 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  35.75 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  33.94 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  32.36 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  30.52 
 
 		 351 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  27.66 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  31.1 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  23.87 
 
 		 740 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  28.95 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.69 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  28.74 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  30.59 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  30.36 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  29.11 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  27.91 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30.26 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  29.66 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  27.97 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  29.96 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  29.66 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  29.66 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  29.66 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  34.62 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.13 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  29.64 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  25.31 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  26.38 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  28.52 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  25.76 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25.49 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  28.52 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.06 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  33.96 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  26.67 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  27.2 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.9 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  26.67 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  25.32 
 
 		 741 aa  63.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  27.81 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  29.66 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  29.48 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  28.45 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  24.38 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  37.21 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  28.28 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  27.16 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  24.21 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  28.71 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  26.83 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  26.47 
 
 		 324 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  25 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  26.86 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  26.58 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  27.31 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  26.03 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  26.03 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  27.5 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  26.03 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  28.45 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  27.66 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.63 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  24.9 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  24.07 
 
 		 760 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  26.58 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  23.03 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.27 
 
 		 751 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.27 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  25.73 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  26.97 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.91 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.27 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  25.31 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  26.85 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  24.07 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  27.14 
 
 		 272 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  28.99 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  26.46 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  26.46 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  31.78 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.49 
 
 		 727 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  38.55 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  26.46 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  28.63 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.61 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  25.33 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  33.61 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  33.61 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.61 
 
 		 306 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  25.95 
 
 		 733 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  26.67 
 
 		 262 aa  57  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  27.97 
 
 		 728 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  33.61 
 
 		 347 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  33.61 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  28.05 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>