233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0816 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0816  patatin  100 
 
 
413 aa  846    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  46.54 
 
 
420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  49.05 
 
 
397 aa  329  6e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  34.57 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  37.14 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  35.62 
 
 
394 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  34.3 
 
 
424 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  33.15 
 
 
411 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  31.97 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.3 
 
 
748 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  27.16 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  33.33 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  27.95 
 
 
753 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  27.47 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.13 
 
 
751 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  28.15 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  25.9 
 
 
737 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.95 
 
 
728 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  29.83 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  27.33 
 
 
796 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.61 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.57 
 
 
728 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.92 
 
 
728 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.73 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.93 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.93 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  24.48 
 
 
736 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  27.63 
 
 
798 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  29.67 
 
 
298 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.51 
 
 
767 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  23.36 
 
 
738 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  29.66 
 
 
728 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  23.77 
 
 
739 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  28.24 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  23.36 
 
 
738 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  25.61 
 
 
738 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  28.11 
 
 
813 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  26.13 
 
 
727 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  26.27 
 
 
735 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  30.21 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  29.57 
 
 
327 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  25.1 
 
 
754 aa  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  28.11 
 
 
803 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.25 
 
 
316 aa  63.9  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  28.11 
 
 
803 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  28.11 
 
 
803 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  28.92 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  28 
 
 
933 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  28 
 
 
920 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  27.6 
 
 
852 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  25.97 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.86 
 
 
728 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  27.85 
 
 
275 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  28 
 
 
945 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  28 
 
 
930 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  28 
 
 
728 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  24.48 
 
 
751 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  37.74 
 
 
317 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  30.04 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  34.86 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  34.86 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  34.86 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  35.51 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  29.17 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  27.31 
 
 
804 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  34.86 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  34.86 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  29.46 
 
 
667 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  34.86 
 
 
263 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  27.35 
 
 
324 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  26.05 
 
 
303 aa  60.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  27.42 
 
 
315 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  34.15 
 
 
714 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35.51 
 
 
263 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  23.87 
 
 
734 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  36.46 
 
 
263 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  36.46 
 
 
263 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  24.11 
 
 
740 aa  59.7  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  24.74 
 
 
741 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  23.27 
 
 
737 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.42 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  23.27 
 
 
738 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.67 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  23.27 
 
 
738 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.44 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  25.41 
 
 
273 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  25.84 
 
 
790 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  22.98 
 
 
738 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  38 
 
 
253 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  28.52 
 
 
288 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  22.73 
 
 
740 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  26.89 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  26.89 
 
 
474 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  27.35 
 
 
733 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  24.8 
 
 
760 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  29.81 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  30.15 
 
 
382 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  22.86 
 
 
738 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.84 
 
 
746 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  26.89 
 
 
347 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>