172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1045 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  100 
 
 		 322 aa  634    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  31.11 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  30.7 
 
 		 411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  31.85 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  34.49 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  31.94 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  30.8 
 
 		 424 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  31.37 
 
 		 398 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  31.27 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  29.17 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 358 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  34.16 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.37 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  34.16 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  34.16 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.37 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  34.16 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.74 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  32.2 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  28.14 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  30.58 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  29.64 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  34.65 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  32 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  30.96 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  28.14 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  31.78 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  31.78 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  28.47 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  30.17 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.54 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  42.42 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  26.47 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.04 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  26.8 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  29.63 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  32.3 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  32.3 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  29.69 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  27.65 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  30.71 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  26.96 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  26.96 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  26.96 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  29.44 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  30.54 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  29.3 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.54 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.7 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30.86 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  29.8 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  25.77 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25.77 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  28.9 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  29.23 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  29.29 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  32.51 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  33.05 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  29.76 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.47 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  28.05 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30.83 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  28.28 
 
 		 740 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  44.19 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  28.22 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  28.33 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.18 
 
 		 767 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.99 
 
 		 741 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  27.54 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  31.44 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  27 
 
 		 760 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  26.38 
 
 		 735 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  30.12 
 
 		 271 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  29.41 
 
 		 751 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.75 
 
 		 740 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  41.38 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  25.24 
 
 		 253 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  23.89 
 
 		 737 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  24.41 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  31.34 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  25.46 
 
 		 734 aa  50.1  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  28.67 
 
 		 753 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  26.82 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.73 
 
 		 728 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.99 
 
 		 728 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  37.04 
 
 		 216 aa  49.3  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  31.19 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  25.11 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.31 
 
 		 727 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  25.76 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  26.32 
 
 		 748 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  36 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  26.38 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  24.91 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  24.53 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  24.91 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  24.91 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  24.91 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25.49 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>