149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0564 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0564  Patatin  100 
 
 		 351 aa  688    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  30.46 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  36.2 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  33.01 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  32.86 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  24.04 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  24.04 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  24.04 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  28.57 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  30.04 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  32 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  31.8 
 
 		 343 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  29.43 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  27.97 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  26.58 
 
 		 397 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  30.41 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  28.85 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  30.34 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  30.29 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  26.98 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  30.71 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  30.71 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  26.99 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  30.74 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  25.44 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  30.04 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.33 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  28.22 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  30.4 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  30.63 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  28.57 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  25.57 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  28.89 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  30.74 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  25.12 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  26.82 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  25 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  28.19 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  28.05 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  25.79 
 
 		 714 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  32.99 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  29.86 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1002 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  29.84 
 
 		 1678 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  27.35 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  29.05 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  34.08 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  28.42 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.97 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  25.3 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  26.63 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  28.26 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.46 
 
 		 748 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  30.9 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  26.56 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  29.9 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  23.96 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  23.96 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  40.51 
 
 		 2272 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  27.18 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  26.51 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  22.18 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  22.54 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  25.34 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  27.04 
 
 		 741 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  25.34 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4239  Patatin  29.44 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  25.41 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  25.14 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25.84 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  23.59 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  25 
 
 		 686 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  24.44 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  28.28 
 
 		 264 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  25.35 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  26.83 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  25.87 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  21.84 
 
 		 293 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  21.5 
 
 		 334 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  22.96 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  24.45 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  24.53 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  21.84 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  24.72 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  26.11 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  26.11 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  27.35 
 
 		 615 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  29.12 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  22.94 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  26.11 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  20.66 
 
 		 279 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  24.35 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  24.87 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  23.63 
 
 		 420 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>