183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4686 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  100 
 
 		 283 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  55.81 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  48.84 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  42.64 
 
 		 276 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  44.73 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  39.78 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  42.8 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  38.24 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  38.24 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  37.87 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  37.46 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  39.07 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  39.07 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  36.79 
 
 		 331 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  35.77 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  36.64 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  32.13 
 
 		 330 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  33.74 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  30.82 
 
 		 351 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  30.54 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  26.47 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  33.88 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  31.65 
 
 		 322 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  32.37 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  31.08 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  31.96 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  35.29 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  31.73 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.65 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.54 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.5 
 
 		 798 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  33.51 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  33.51 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  30.26 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  32.08 
 
 		 852 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.36 
 
 		 796 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  31.58 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  31.25 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.6 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.24 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.24 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.24 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  31.2 
 
 		 804 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.33 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  30.17 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.33 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  24.35 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  27.21 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  31.55 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  31.28 
 
 		 933 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  31.55 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.24 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.73 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  30.51 
 
 		 803 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  30.51 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  30.51 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  39.18 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  31.28 
 
 		 945 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  31.55 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  31.55 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  31.78 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  31.28 
 
 		 920 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  27.08 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  31.28 
 
 		 930 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  31.28 
 
 		 728 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  29.47 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  31.28 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.92 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  30.66 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  30.24 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  28.26 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  32.69 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  29.8 
 
 		 707 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  29.76 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  28.51 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  26.98 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  30.53 
 
 		 714 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.77 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  26.27 
 
 		 346 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.2 
 
 		 757 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.66 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  46.67 
 
 		 145 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  26.27 
 
 		 346 aa  52.4  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  29.17 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  28.57 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  31.43 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  30.57 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  30.57 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.1 
 
 		 790 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.32 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1235  hypothetical protein  41.07 
 
 		 579 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1235  hypothetical protein  41.07 
 
 		 579 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.32 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.9 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  28.62 
 
 		 813 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.34 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  29.15 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.21 
 
 		 757 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  25.85 
 
 		 775 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.21 
 
 		 757 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>