27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3330 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3330  Patatin  100 
 
 		 330 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  62.92 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  58.73 
 
 		 296 aa  335  5e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  53.33 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  37.34 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  39.87 
 
 		 283 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  39.76 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  31.61 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  32.23 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  32.53 
 
 		 294 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  32.23 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  32.23 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  33.01 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  36.65 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  32.27 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  31.23 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  31.05 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  30.72 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  37.96 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  42.19 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  27.78 
 
 		 411 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  28.92 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  24.34 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  26.01 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  29.96 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  26.99 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  42.86 
 
 		 424 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>