45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  100 
 
 		 284 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  51.2 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  44.4 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  41.96 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  39.03 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  39.29 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  39.29 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  38.67 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  38.93 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  38.46 
 
 		 331 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  37.71 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  36.17 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  39.31 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  38.49 
 
 		 276 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  42.33 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  35.93 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  43.64 
 
 		 299 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  36.86 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  33.03 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  35.98 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  31.17 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  30.86 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  30.48 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  27.3 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  32.92 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  32.23 
 
 		 411 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  40.58 
 
 		 145 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  32.18 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  25.73 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  30.52 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 583 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  28.63 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  27.86 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  27.4 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  34.38 
 
 		 331 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  27.86 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  26.9 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  26.87 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  32.5 
 
 		 581 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.67 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  30.04 
 
 		 345 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  29.41 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  26.24 
 
 		 474 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  31.18 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  26.5 
 
 		 347 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>