128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1891 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1891  patatin  100 
 
 		 296 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  42.75 
 
 		 288 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  44.06 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  44.71 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  38.22 
 
 		 276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  38.63 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  38.63 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  38.27 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  38.13 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  36.5 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.11 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  37.07 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  33.7 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  36.44 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  35.04 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  37.72 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  38.58 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  34.32 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  28.25 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  30.86 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  29.54 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  30.88 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  28.81 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  28.05 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  27.67 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  29.75 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  30.48 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  31.55 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  32.38 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  31.02 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  28.95 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  29.08 
 
 		 420 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  33.68 
 
 		 145 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  40.24 
 
 		 413 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.24 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.24 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  26.67 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  28.8 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  30.59 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  27.6 
 
 		 933 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  28.65 
 
 		 474 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  27.6 
 
 		 920 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  27.4 
 
 		 852 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  27.6 
 
 		 945 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  27.27 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  27.6 
 
 		 714 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  27.27 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  27.6 
 
 		 930 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  27.6 
 
 		 728 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  32.84 
 
 		 707 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  28.57 
 
 		 347 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  30.48 
 
 		 358 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  26.62 
 
 		 347 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.15 
 
 		 767 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  30.43 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.27 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  29.28 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  26.62 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  27.32 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.1 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  24.68 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  27.63 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  28 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  24.68 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  24.68 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.13 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  30.88 
 
 		 357 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  40.91 
 
 		 352 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  38.16 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  27.7 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  31.42 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  28.51 
 
 		 813 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  27.92 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  29.34 
 
 		 728 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  40.91 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  32.04 
 
 		 356 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  30.77 
 
 		 454 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  28.79 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  29.14 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  39.22 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  29.25 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  28.63 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  25.5 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  28.57 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  28.04 
 
 		 745 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  26.48 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  36.49 
 
 		 739 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  31.49 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  33.33 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  29.36 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  23.93 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  40.26 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.25 
 
 		 760 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  30.92 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  40.91 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  39.62 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  31.09 
 
 		 790 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>