57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6318 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6318  patatin  100 
 
 		 454 aa  884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  73.37 
 
 		 409 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  64.38 
 
 		 434 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  64.12 
 
 		 431 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  64.12 
 
 		 437 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  44.52 
 
 		 423 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  42.52 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  41.64 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  39.18 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  42.94 
 
 		 403 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  41.21 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  42.19 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  41.48 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  41.34 
 
 		 397 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  40.05 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  40.05 
 
 		 397 aa  216  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  40.16 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  37.95 
 
 		 424 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  42.86 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  41.67 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  42.27 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  39.66 
 
 		 389 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  36.42 
 
 		 410 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  41.64 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  42.52 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  38.83 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  34.95 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  38.78 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  38.78 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  38.78 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  34.69 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  40.49 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  40.51 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  29.74 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  32.56 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  32.16 
 
 		 308 aa  50.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  31.58 
 
 		 291 aa  50.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  32.57 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  32.57 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  29.65 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  28.07 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  29 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.31 
 
 		 294 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  27.8 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  29.29 
 
 		 309 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  31.18 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  27.21 
 
 		 317 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  34.26 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  28.08 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  28.98 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  30.36 
 
 		 310 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  30 
 
 		 305 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  26.07 
 
 		 319 aa  43.9  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  26.9 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  30.43 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  30.05 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  30.05 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>