39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1768 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1768  patatin  100 
 
 		 418 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  100 
 
 		 418 aa  857    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  100 
 
 		 418 aa  857    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  43.15 
 
 		 423 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  38.29 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  38.04 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  39.8 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  39.4 
 
 		 411 aa  239  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  38.38 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  41.43 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  36.48 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  38.8 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  35.16 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  39.59 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  39.59 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  39.38 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  36.8 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  38.56 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  39.13 
 
 		 389 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  38.23 
 
 		 396 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  37.41 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  36.91 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  33.42 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  47.95 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  37.44 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  38.78 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  34.08 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  40.46 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  40.77 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  36.46 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  40.38 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  35.19 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  33.55 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  32.26 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2927  patatin  40 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.224599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  26.09 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  24.24 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  24.38 
 
 		 290 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  26.61 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>