99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5658 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  100 
 
 		 393 aa  802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  42.9 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  42.35 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  47.28 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  41.48 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  42.44 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  45.78 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  40.83 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  40.9 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  39.95 
 
 		 424 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  40.62 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  40.62 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  37.95 
 
 		 423 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  40 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  40.59 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  39.37 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  40.45 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  41.51 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  38.46 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  42.77 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  42.46 
 
 		 437 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  41.8 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  38.39 
 
 		 410 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  36.94 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  36.51 
 
 		 409 aa  215  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  40.89 
 
 		 403 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  31.79 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  31.79 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  34.08 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  34.08 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  34.08 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  37.46 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  36.61 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  29.41 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  23.96 
 
 		 250 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.11 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  30.77 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  26.73 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  29.38 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  29.3 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  26.22 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  30.73 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  30.73 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  27.84 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  32.16 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  30.24 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  30.24 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  29.22 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  27.97 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  28.73 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 584 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  30.15 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.36 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  28.73 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  27.89 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  27.85 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.12 
 
 		 293 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.27 
 
 		 319 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  29.76 
 
 		 374 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  25.89 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  26.45 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  40 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  29.53 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  27.87 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  27.92 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  29.7 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  44.12 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  29.25 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  29 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  26.76 
 
 		 750 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  29.7 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  36.94 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  55.1 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  29.95 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  30.18 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  30.65 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  27.98 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 748 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  28.23 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  28.23 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  24.68 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  28.23 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  30.34 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 594 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  26.78 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  28.25 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  26.42 
 
 		 336 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  31.43 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  28.23 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  45.83 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  28.57 
 
 		 294 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  28.27 
 
 		 263 aa  43.1  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  30.27 
 
 		 323 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  28.8 
 
 		 312 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  28.28 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  27.42 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  28.51 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  25.41 
 
 		 581 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  26.67 
 
 		 392 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>