41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2755 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2755  Patatin  100 
 
 		 409 aa  832    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  71.39 
 
 		 406 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  52.07 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  49.6 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  42 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  39.62 
 
 		 410 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  40.78 
 
 		 412 aa  266  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  38.17 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  37.82 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  38.38 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  38.38 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  38.38 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  41.99 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  43.87 
 
 		 389 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  43.59 
 
 		 397 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  43.59 
 
 		 397 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  43.27 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  41.21 
 
 		 454 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  39.84 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  41.85 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  38.94 
 
 		 395 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  38.59 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  36.51 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  37.7 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  36.86 
 
 		 397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  37.93 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  38.25 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  38.07 
 
 		 434 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  33.6 
 
 		 396 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  37.77 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  39.2 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  32.87 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  34.03 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  29.36 
 
 		 380 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.72 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  26.55 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  26.55 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  32.83 
 
 		 310 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  29.17 
 
 		 495 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  26.99 
 
 		 312 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>