70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2174 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  100 
 
 		 396 aa  803    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  74.49 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  74.94 
 
 		 397 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  71.03 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  52.31 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  52.3 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  52.3 
 
 		 397 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  53.15 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  56.37 
 
 		 395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  56.32 
 
 		 395 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  49.48 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  42.9 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  42.45 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  40.85 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  41.3 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  41.64 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  37.47 
 
 		 424 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  36.74 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  39.94 
 
 		 410 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  41.29 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  39.18 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  40.38 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  38.23 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  38.23 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  38.23 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  35.77 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  35.59 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  38.18 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  39.94 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  39.39 
 
 		 437 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  38.26 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  39.4 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  38.85 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  27.47 
 
 		 380 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  27.89 
 
 		 298 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  27.19 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.26 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  28.35 
 
 		 327 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  27.23 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  31.03 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  25.65 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  25.65 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1065 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  29.41 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  27.45 
 
 		 581 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  27.78 
 
 		 317 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2334  hypothetical protein  23.58 
 
 		 665 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1588  patatin  29.28 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  28.35 
 
 		 1048 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02340  lipid particle protein, putative  25 
 
 		 871 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  25 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01156  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily protein  26.23 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  27.63 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.81 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  28.44 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.32 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.73 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  26.78 
 
 		 584 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.52 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  28.82 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2479  hypothetical protein  22.03 
 
 		 661 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  24.3 
 
 		 275 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  30.05 
 
 		 375 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  46.97 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  28.57 
 
 		 241 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  29.13 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  31.96 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  29.56 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  28.08 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>