39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0164 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0164  patatin  100 
 
 		 406 aa  827    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  71.39 
 
 		 409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  51.17 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  49.23 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  42.38 
 
 		 424 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  42.78 
 
 		 412 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  37.31 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  36.54 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  43.22 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  41.88 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  36.48 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  36.48 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  36.48 
 
 		 418 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  36.32 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  41.48 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  38.1 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  40.45 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  43.45 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  43.45 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  43.45 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  43.45 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  40.26 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  39.2 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  41.64 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  42.54 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  40.38 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  40.25 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  39.94 
 
 		 434 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  39.74 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  37.85 
 
 		 396 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  36.84 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  34.9 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  32.87 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  29.41 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  26.24 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  26.24 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  27.55 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.05 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  26.46 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>