39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4284 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  100 
 
 		 437 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  84.75 
 
 		 434 aa  716    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  98.17 
 
 		 431 aa  790    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  64.12 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  57.58 
 
 		 409 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  42.37 
 
 		 423 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  42.86 
 
 		 395 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  42.28 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  39.33 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  40.67 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  40 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  38.62 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  38.3 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  39.02 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  39.02 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  38.65 
 
 		 396 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  40.25 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  38.71 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  39.95 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  38.68 
 
 		 400 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  38.12 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  40.25 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  38.94 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  37.77 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  35.24 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  38.38 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  33.93 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  33.93 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  40.38 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  37.21 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  40.38 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  40.38 
 
 		 418 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  35.18 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  28.85 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  31.03 
 
 		 310 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  27.94 
 
 		 290 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.42 
 
 		 303 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  29.44 
 
 		 306 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  29.44 
 
 		 306 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>