86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0147 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0147  Patatin  100 
 
 		 380 aa  771    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1656  patatin family phospholipase  32.26 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1768  patatin  32.26 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3530  patatin family phospholipase  32.26 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288489  normal  0.0848725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5259  patatin  33.02 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6656  patatin  27.62 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0368  hypothetical protein  26.85 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0343  hypothetical protein  26.85 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3783  hypothetical protein  28.36 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7175  Patatin  30.1 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.656867  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2755  Patatin  29.45 
 
 		 409 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3027  patatin  29.21 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5819  Patatin  31.21 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4284  patatin  32.5 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4884  Patatin  29.59 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4420  patatin  29.59 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0052323  normal  0.804694 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5658  Patatin  29.03 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595864  normal  0.124932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4930  Patatin  28.99 
 
 		 397 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.149942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2174  Patatin  27.47 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6391  alpha/beta superfamily hydrolase  30.24 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1086  patatin  27.02 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3360  patatin  27.48 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0164  patatin  29.41 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.607133  normal  0.62412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6318  patatin  34.06 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3916  patatin  29.17 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.158973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4284  Patatin  28.85 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2253  patatin  26.89 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4389  Patatin  28.21 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.525618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1962  patatin  27.3 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.105403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3407  patatin  27.14 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2041  patatin  25.96 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3579  patatin  24.23 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4658  patatin  32.28 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.631828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2447  patatin  31.37 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191371  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  34.07 
 
 		 384 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  28.95 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  28.12 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  30.34 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  27.75 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  27.83 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  29.38 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  28.51 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  31.34 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  26.23 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  27.69 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  27.69 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  27.69 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  30.73 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  30.36 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  27.69 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  27.66 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  28.7 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  27.2 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  26.15 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  27.27 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  25.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  27.57 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  27.57 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  25.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  25.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  24 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  27.87 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  28.38 
 
 		 389 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  26.02 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  25.52 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  28.37 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  25.11 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  25.11 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  26.26 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  24.17 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  27.85 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  25.64 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  26.22 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  26.77 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  27.47 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  26.67 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  27.08 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  27.51 
 
 		 389 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  26.34 
 
 		 374 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  26.55 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  25.1 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>