141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1374 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  100 
 
 		 366 aa  743    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  33.43 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  31.25 
 
 		 354 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  30.99 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  34.21 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  34.21 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  34.21 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  30.84 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  29.71 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  30.42 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  30.09 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  28.86 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  29.23 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  36.2 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  34.5 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  32.29 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  37 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  27.33 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  33.21 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  32.82 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  32.82 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  29.03 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  27.9 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  34.07 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  33.5 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  26.92 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  27.78 
 
 		 334 aa  95.9  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  27.74 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1002 aa  94.4  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  26.12 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  30.48 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  31.62 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  30.05 
 
 		 377 aa  89.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  31.09 
 
 		 397 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  30.4 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  30.4 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  30.4 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  30.4 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  30.4 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  30.4 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  26.56 
 
 		 1678 aa  87.4  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  31.06 
 
 		 686 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  30.13 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  30.43 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  26.18 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  29.86 
 
 		 554 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  28.02 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  28.57 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  25.24 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  23.31 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  26.15 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  22.09 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  27.78 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  27.27 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  26.79 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  27.03 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  25.32 
 
 		 714 aa  63.2  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  28.35 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.81 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  41.46 
 
 		 2272 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1881  Patatin  29.56 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00591765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  24.38 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  25.43 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  25.91 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  46.97 
 
 		 615 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  27.59 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  27.78 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  28.22 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.41 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  28.43 
 
 		 319 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  27.09 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  25.22 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  25.22 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  24.28 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.04 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  26.9 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  23.4 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  29.44 
 
 		 339 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  26.8 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1401  patatin  26.42 
 
 		 264 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0324222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  27.11 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  27.4 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  28.87 
 
 		 251 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  24.58 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  23.86 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  26.4 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  28.79 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  26.34 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  24.03 
 
 		 1113 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.65 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  25.25 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  22.93 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  27.89 
 
 		 259 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  25.45 
 
 		 621 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  24.75 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  26.9 
 
 		 308 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  24.59 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  26.85 
 
 		 253 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  24.78 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>