65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2010 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  100 
 
 		 342 aa  714    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  38.32 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  38.35 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  35.61 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  34.26 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  32.63 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  33.62 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1002 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  33.24 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  35.21 
 
 		 686 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  31.92 
 
 		 554 aa  157  3e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  33.52 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  30.17 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  31.53 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  29.06 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  26.84 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  30.52 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  27.65 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  29.41 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  27.06 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  30.32 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  30.74 
 
 		 336 aa  99.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  29.18 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  26.75 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  26.75 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  26.75 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  27.6 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  26.51 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  32.54 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  24.48 
 
 		 329 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  28.35 
 
 		 358 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  24.87 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  27.03 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  23.41 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  26.93 
 
 		 2272 aa  79.7  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  25.52 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  28.38 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  27.8 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  27.11 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  27.11 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  23.34 
 
 		 1678 aa  72.8  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  26.39 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  26.39 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  27.05 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  27.57 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  26.69 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  24.78 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  22.61 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  25.28 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  26.18 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  29.84 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  23.85 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  26.07 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  25.85 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  26.42 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  25.37 
 
 		 318 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  24.43 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  24.23 
 
 		 1113 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  23.23 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  24.24 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>