167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4351 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  100 
 
 		 312 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  34.8 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  36.1 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  39.15 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  39.15 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  39.15 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  32.7 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  31.21 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  33.45 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  30.46 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  31.44 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  33.81 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  37.63 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  33.21 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  34.83 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  36.44 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  35.94 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  31.18 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  29.31 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  33.33 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  37 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  32.5 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  33.8 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  33.47 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  31.2 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  27.33 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  31.05 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  31.05 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  31.05 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  34.23 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  31.05 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  30.65 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  34.23 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  34.23 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  30.65 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  30.65 
 
 		 397 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  28.89 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  30.12 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  31.53 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  29.41 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1002 aa  99.8  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  31.99 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  32.73 
 
 		 686 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  31.25 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  30.1 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  31.3 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  30.3 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.89 
 
 		 382 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  30.54 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  28.34 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  27.34 
 
 		 554 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  26.36 
 
 		 1678 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  28.89 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  29.27 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  31.15 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  28.08 
 
 		 714 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  33.33 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  27.34 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  27.51 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  26 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  28.14 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  28.8 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  28.26 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  26.74 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  28.88 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  28.88 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  28.88 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.73 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  29.35 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.81 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  30.94 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  26.13 
 
 		 306 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  26.13 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  26.13 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  28.93 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  26.13 
 
 		 474 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0866  patatin-like phospholipase family protein  25.74 
 
 		 363 aa  55.5  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  26.13 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  23.35 
 
 		 740 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  27.9 
 
 		 728 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  30.05 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.3 
 
 		 728 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  26.63 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  29.78 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  26.23 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  27.47 
 
 		 728 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  27.34 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  27.47 
 
 		 751 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  28.16 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  27.9 
 
 		 727 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  27.01 
 
 		 728 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  26.63 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  28.12 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  25.11 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  26.63 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  25.11 
 
 		 419 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  26.61 
 
 		 733 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  24.4 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>