77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06340  patatin  100 
 
 		 308 aa  610  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  82.95 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  82.95 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  82.95 
 
 		 371 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  37.83 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  38.56 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  36.99 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  36.59 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  37.63 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  37.8 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  41.51 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  34.3 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  34.5 
 
 		 366 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  33.46 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  33.06 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  33.99 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  31.53 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  33.46 
 
 		 367 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  26.98 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  36.36 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  25.54 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  27.78 
 
 		 686 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  30.77 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  27.69 
 
 		 365 aa  89.4  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  29.64 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  29.06 
 
 		 302 aa  89  8e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  29.46 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  25.61 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1002 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  25.61 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  29.61 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  27.57 
 
 		 554 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  25.18 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  33.18 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  32.88 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  32.88 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  32.88 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  34.11 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  34.11 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  32.73 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  33.95 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  32.42 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  32.42 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  29.38 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  27.78 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  27.44 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  33.51 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  26.84 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  28.99 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  29.85 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  24.27 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  24.58 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  27.14 
 
 		 1678 aa  52.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  35.05 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  21.62 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  28.72 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  31.28 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  23.87 
 
 		 446 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  34.69 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  32.43 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  27.09 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  29.91 
 
 		 1113 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  26.09 
 
 		 394 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  26.86 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  26.3 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  27.61 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  24.07 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0218  patatin  25.48 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0216  patatin  25.48 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  32.97 
 
 		 379 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  33.65 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  33.65 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  24.87 
 
 		 771 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  25.99 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  21.88 
 
 		 714 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  31.48 
 
 		 378 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>