37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46193 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  100 
 
 
1113 aa  2301    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  26.48 
 
 
714 aa  127  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  27.35 
 
 
2272 aa  97.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  28.72 
 
 
1678 aa  96.3  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  25.77 
 
 
320 aa  92.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  23.24 
 
 
615 aa  65.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  24.22 
 
 
365 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 
350 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  26.3 
 
 
344 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  25.95 
 
 
344 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  24.48 
 
 
343 aa  56.6  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  35.14 
 
 
302 aa  54.3  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  44.26 
 
 
358 aa  53.5  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  28.57 
 
 
371 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  26.92 
 
 
390 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  28.57 
 
 
371 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  28.57 
 
 
371 aa  53.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  23.37 
 
 
337 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  26.69 
 
 
309 aa  52.4  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  33.71 
 
 
363 aa  52  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  36.9 
 
 
367 aa  50.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  50 
 
 
336 aa  50.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  27.63 
 
 
382 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  30.5 
 
 
333 aa  50.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  30 
 
 
312 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  28.76 
 
 
354 aa  48.5  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  26.64 
 
 
374 aa  48.5  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  43.94 
 
 
377 aa  47.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  24.03 
 
 
366 aa  48.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  38.67 
 
 
324 aa  47  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  30.61 
 
 
340 aa  46.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  47.83 
 
 
707 aa  46.6  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  44.44 
 
 
302 aa  46.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  29.91 
 
 
308 aa  46.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  45.61 
 
 
320 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  26.87 
 
 
1002 aa  45.1  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  29.41 
 
 
256 aa  45.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>