67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0555 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0555  patatin  100 
 
 		 343 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  43.43 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  43.73 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  41.86 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  41.29 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  36.1 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  33.88 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  38.06 
 
 		 371 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  38.06 
 
 		 371 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  38.06 
 
 		 371 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  34.38 
 
 		 337 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  37.8 
 
 		 308 aa  135  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  31.51 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  37.44 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  35.08 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  35.42 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  35.24 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  31.8 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  29.03 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  28.48 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  34.21 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  31.89 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  33.47 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  30.43 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  28.06 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  31.2 
 
 		 1678 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  28.98 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1002 aa  95.5  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  33.2 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  33.2 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  30.17 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  30.74 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  32.79 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  29.55 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  32.5 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  32.63 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  32.5 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  32.5 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  32.5 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  32.08 
 
 		 397 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  32.64 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  32.08 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  32.08 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  31.89 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  26.27 
 
 		 315 aa  87  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  32.55 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  28.39 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  30.56 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  31.11 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  28.16 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  32.84 
 
 		 2272 aa  72.8  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  29.37 
 
 		 686 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  23.46 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  26.51 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  30.47 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  26.19 
 
 		 714 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  30.63 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  26.53 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  24.48 
 
 		 1113 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  45.45 
 
 		 615 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.487308 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09241  conserved hypothetical protein  34.31 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10408  normal  0.281158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 597 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  24.58 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  38.67 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  24 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  25 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>