67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0119 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0119  patatin  100 
 
 
390 aa  811    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  38.12 
 
 
337 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  37.83 
 
 
312 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  30.52 
 
 
320 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  31.82 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  30.86 
 
 
365 aa  124  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  31.17 
 
 
302 aa  119  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  30.46 
 
 
343 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  28.21 
 
 
309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  29.23 
 
 
340 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  31.81 
 
 
686 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  25.76 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  29.69 
 
 
342 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  30.5 
 
 
363 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  26.85 
 
 
336 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  25.52 
 
 
1002 aa  106  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  29.5 
 
 
356 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  28.51 
 
 
366 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  29.57 
 
 
326 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  30.66 
 
 
358 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  28.76 
 
 
371 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  28.76 
 
 
371 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  28.76 
 
 
371 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  30.21 
 
 
374 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  27.45 
 
 
329 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  28.31 
 
 
377 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  29.71 
 
 
336 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  29.71 
 
 
336 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  26.52 
 
 
554 aa  98.2  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  29.02 
 
 
340 aa  96.7  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  28.31 
 
 
336 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  27.89 
 
 
337 aa  96.3  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  26.92 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  26.92 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  26.92 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  26.92 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  26.92 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  26.92 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  26.92 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  28.85 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  26.35 
 
 
311 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  29.24 
 
 
344 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  27.6 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  30.11 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  30 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  25.97 
 
 
446 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  30.88 
 
 
324 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1954  hypothetical protein  28.53 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.461887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  32.14 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  25.93 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  26.32 
 
 
326 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06340  patatin  26.69 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  27.04 
 
 
1678 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  28.23 
 
 
714 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  27.36 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0999  patatin  26.77 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  40.26 
 
 
2272 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  22.83 
 
 
320 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  24.16 
 
 
1113 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1012  patatin  22.67 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  26.67 
 
 
267 aa  50.8  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  43.33 
 
 
615 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487308 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09241  conserved hypothetical protein  54.35 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10408  normal  0.281158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  23.83 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  28.45 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  28.45 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>