69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2676 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2676  Patatin  100 
 
 
446 aa  912    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1381  Patatin  32.27 
 
 
377 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536122  hitchhiker  0.000759695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4294  patatin  26.92 
 
 
382 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1796  patatin  30.72 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259053  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0119  patatin  27.95 
 
 
390 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0130  patatin  26.78 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0555  patatin  25.89 
 
 
343 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715173  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4648  Patatin  27.7 
 
 
320 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000569518 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.58 
 
 
1002 aa  89.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1230  patatin  28.19 
 
 
358 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.17654  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4351  patatin  27.34 
 
 
312 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0022  patatin family protein  25.88 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000233601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3245  patatin  27.72 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0548  patatin  27.14 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2292  patatin  26.26 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1036  Patatin  23.59 
 
 
337 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0565  patatin family protein  27.05 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3957  patatin  27.96 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4410  patatin  27.96 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.55652  normal  0.642235 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0182  patatin  23.93 
 
 
315 aa  76.3  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.117246  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5594  Patatin  27.63 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1116  hypothetical protein  24.61 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5947  patatin  27.3 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636899  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0564  Patatin  27.4 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2542  patatin  27.67 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0165038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0211  patatin  27.91 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1374  patatin-related protein  24.9 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.19767  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03318  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06310)  25.93 
 
 
1678 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.555482  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0575  Patatin  25 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0962  hypothetical protein  25.85 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1320  Patatin  27.1 
 
 
367 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0968  hypothetical protein  27.59 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.381758 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0952  patatin-like protein  25.72 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5143  patatin  26.42 
 
 
324 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.527098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2010  patatin-like protein  29.84 
 
 
342 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.047223  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3237  patatin  24.91 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3175  patatin  24.91 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3187  patatin  24.91 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2320  patatin  25.86 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.897754  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0727  patatin-like phospholipase  24.39 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1710  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1585  patatin  35.14 
 
 
311 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.686597  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24547  predicted protein  24.9 
 
 
2272 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.733966  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0593  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.562106  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2236  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1667  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0715  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1918  patatin-like phospholipase  25.86 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05402  conserved hypothetical protein  24.08 
 
 
350 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.924738  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1257  patatin  26.52 
 
 
320 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  22.91 
 
 
326 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4663  patatin  24.76 
 
 
333 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3753  Patatin  23.23 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6025  patatin  31.19 
 
 
354 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0870919  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10747  Patatin-like serine hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07870)  32.95 
 
 
615 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.487308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1620  patatin  25.35 
 
 
686 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128083  normal  0.0419711 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32074  predicted protein  35.37 
 
 
714 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0337279  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  25.19 
 
 
321 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  25.29 
 
 
321 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  25.19 
 
 
321 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  24.9 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46193  predicted protein  41.03 
 
 
1113 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  24.9 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  24.9 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  24.9 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  24.9 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  24.9 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  23.7 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  22.94 
 
 
420 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>